Un logiciel de comptabilité automatise les devis, factures, suivi fournisseurs et déclarations TVA. Depuis le 1er janvier 2026, la facturation électronique via Peppol est obligatoire pour toutes les transactions B2B entre assujettis TVA belges.
Quel outil choisir selon votre statut ? Un logiciel peut-il remplacer un expert-comptable ? Et quelle est la différence entre comptabilité simplifiée et double ?
Vos experts-comptables myfid comparent les logiciels disponibles en 2026, avec un avis honnête sur ce qu’ils font et ce qu’ils ne feront jamais.
Table des matières
- L’info en 5 points-clés
- Quel logiciel comptable choisir en 2026 ? Le tableau comparatif
- Les logiciels self-service pour indépendants personnes physiques
- Les logiciels professionnels (pour fiduciaires et PME)
- L’e-facturation obligatoire depuis janvier 2026 : ce que cela change
- Franchise TVA et coût réel du logiciel : un calcul que peu d’indépendants font
- Quand le passage en société change la donne
- Logiciel ou comptable : comment choisir ?
- Questions fréquentes
L’info en 5 points-clés
- Depuis janvier 2026, la compatibilité Peppol est obligatoire. Les factures papier et PDF simples ne sont plus acceptées pour les transactions B2B entre assujettis TVA belges. Votre logiciel doit pouvoir émettre et recevoir des factures au format UBL XML via Peppol.
- Les logiciels self-service conviennent aux indépendants personnes physiques en comptabilité simplifiée. Dexxter, Accountable et Sayli gèrent les factures, la TVA et le suivi bancaire. Pour une comptabilité en partie double (sociétés, ASBL), un logiciel professionnel ou un expert-comptable est indispensable.
- Le coût réel du logiciel dépend de votre régime TVA. Un indépendant sous franchise TVA (chiffre d’affaires annuel inférieur à 25 000 EUR) paie son abonnement TVA comprise, sans possibilité de déduction. Un abonnement de 10 EUR/mois coûte en réalité 12,10 EUR.
- Les abonnements aux logiciels de facturation bénéficient d’une déduction majorée de 120 %. Cette mesure fiscale, valable pour les exercices 2024 à 2027, s’applique aux PME et aux indépendants qui investissent dans la facturation électronique.
- Si vous envisagez de passer en société, anticipez le changement de logiciel. Dexxter et Accountable ne gèrent que les personnes physiques. Ce passage est souvent le bon moment pour confier sa comptabilité à un professionnel.
Quel logiciel comptable choisir en 2026 ? Le tableau comparatif
Le tableau ci-dessous compare les logiciels accessibles aux entrepreneurs individuels qui souhaitent tenir leur comptabilité eux-mêmes, ainsi que la solution d’accompagnement myfid.
| Solution | Déclaration TVA | Peppol natif | Suivi par comptable | Prix HTVA |
|---|---|---|---|---|
| myfid | Oui (par votre comptable) | Oui | Oui — conseiller dédié | Dès 65 EUR/mois |
| Dexxter | Oui | Oui | Non | Dès 35 EUR/mois |
| Accountable | Oui (version Pro) | Oui | Non | Dès 10 EUR/mois |
| Sayli | Tableau de bord TVA | Oui | Non | Dès 9 EUR/mois |
| Smoall | Oui | Oui | Non | Sur demande |
| WinBooks | Oui | Oui | Oui (fiduciaires) | Dès 24,36 EUR/mois |
💡 Bon à savoir : FreshBooks et Falco, mentionnés dans certains comparatifs, ne sont pas des solutions belges. Ils ne gèrent pas nativement les obligations TVA belges ni le réseau Peppol. Nous les avons retirés de ce comparatif pour nous concentrer sur les outils réellement adaptés au contexte belge.
Les logiciels self-service pour indépendants personnes physiques
Ces outils s’adressent aux indépendants qui veulent gérer leur comptabilité simplifiée sans expert-comptable. Ils couvrent la facturation, le suivi des dépenses et, pour certains, les déclarations TVA et fiscales.
Dexxter
Dexxter est une plateforme belge de comptabilité autogérée, conçue pour les indépendants personnes physiques. L’interface est en français et en néerlandais. Dexxter propose la déclaration TVA, le listing clients annuel, la déclaration fiscale (IPP) et la clôture des comptes.
La plateforme est compatible Peppol depuis 2025. Dexxter offre une garantie « satisfait ou remboursé » de 60 jours, ce qui permet de tester la solution sans risque.
Limite : Dexxter ne convient pas aux sociétés (SRL, SA). Si vous envisagez le moment de passer en société, vous devrez changer d’outil.
Accountable
Accountable est une application mobile et web qui permet aux indépendants belges d’envoyer des factures, de remplir leurs déclarations (TVA, cotisations sociales, impôts du travailleur indépendant) depuis leur smartphone. L’appli se connecte au compte bancaire de l’utilisateur pour catégoriser automatiquement les transactions.
La version gratuite calcule les impôts. La version Pro (dès 10 EUR/mois) donne accès au traitement complet des factures, aux déclarations TVA et au listing clients. Accountable intègre Peppol et propose la facturation électronique gratuitement.
Limite : comme Dexxter, Accountable ne gère que les personnes physiques.
Sayli
Sayli est un nouvel acteur belge de la facturation électronique, avec le réseau Peppol intégré nativement. L’interface existe en français et en néerlandais. Sayli génère automatiquement les mentions obligatoires belges sur les factures.
Les prix démarrent à 9 EUR/mois. Le forfait PME illimité coûte 29 EUR/mois. Sayli propose un passage du devis à la facture en un clic et un tableau de bord TVA.
Limite : Sayli est avant tout un logiciel de facturation. Il ne propose pas de module de comptabilité avancée (pas de déclaration fiscale, pas de clôture des comptes). Il est conçu pour fonctionner en complément d’un expert-comptable.
Smoall
Smoall est une application de gestion pour PME, freelances et très petites entreprises. Elle couvre la facturation, les devis et le suivi des paiements. Smoall est compatible Peppol.
Limite : Smoall est davantage un outil de gestion commerciale qu’un logiciel comptable complet.
Les logiciels professionnels (pour fiduciaires et PME)
WinBooks
WinBooks est le logiciel choisi par la fiduciaire myfid pour la collaboration entre nos clients et nos experts-comptables. Complet et conforme aux prescriptions légales belges, il permet le suivi des créances, l’accès aux déclarations légales (balances, journaux, déclarations TVA) et une gestion simplifiée avec les chiffres-clés de votre activité mis en évidence.
WinBooks est un logiciel professionnel : il s’adresse aux comptables et fiduciaires, pas aux indépendants en self-service.
Sage BOB
Successeur de Sage BOB 50, Sage BOB est le logiciel de la gamme Sage destiné aux PME et aux fiduciaires. Il permet aux indépendants de saisir leurs factures et de collaborer avec un cabinet comptable externe. Comme WinBooks, c’est un outil professionnel qui suppose un accompagnement.
L’e-facturation obligatoire depuis janvier 2026 : ce que cela change
Depuis le 1er janvier 2026, toutes les factures B2B entre assujettis TVA belges doivent transiter par le réseau Peppol au format UBL XML. Les factures papier et les PDF envoyés par e-mail ne sont plus conformes pour ces transactions.
Une période de tolérance a couru de janvier à mars 2026 : l’administration fiscale n’a pas sanctionné les entreprises qui pouvaient démontrer qu’elles se préparaient. Depuis avril 2026, les sanctions s’appliquent.
Pour le choix de votre logiciel, cela signifie une chose simple : la compatibilité Peppol n’est plus un « plus », c’est un prérequis. Tous les logiciels repris dans notre comparatif (Dexxter, Accountable, Sayli, Smoall, WinBooks) sont compatibles.
La déduction majorée de 120 % pour les logiciels de facturation
Les PME et les indépendants qui souscrivent un abonnement à un logiciel de facturation électronique peuvent déduire 120 % du coût de cet abonnement comme frais professionnel. Cette mesure est valable pour les périodes imposables 2024 à 2027.
Concrètement, un abonnement de 120 EUR/an permet une déduction fiscale de 144 EUR. L’avantage réel dépend de votre taux marginal d’imposition.
Par exemple
Marc est graphiste indépendant à Liège. Il paie un abonnement Sayli à 9 EUR/mois, soit 108 EUR/an HTVA. Grâce à la déduction majorée de 120 %, il déduit 129,60 EUR de ses revenus imposables. Avec un taux marginal de 50 %, l’économie d’impôt s’élève à 64,80 EUR sur l’année, soit plus de la moitié du coût de l’abonnement.
Franchise TVA et coût réel du logiciel : un calcul que peu d’indépendants font
Un indépendant en franchise TVA (chiffre d’affaires annuel inférieur à 25 000 EUR) ne facture pas de TVA à ses clients, mais ne déduit pas non plus la TVA sur ses achats professionnels. Le prix affiché « HTVA » d’un logiciel n’est donc pas son coût réel.
Un abonnement de 10 EUR/mois HTVA coûte 12,10 EUR TTC. Pour un assujetti classique, la TVA de 2,10 EUR est récupérable. Pour un franchisé, elle ne l’est pas. Sur un an, la différence atteint 25,20 EUR. Pour en savoir plus sur la gestion de la TVA en tant qu’indépendant, consultez notre guide complet.
Ce calcul vaut aussi pour tout le matériel professionnel : ordinateur, téléphone, mobilier de bureau. Un indépendant sous franchise paie systématiquement 21 % de plus que son collègue assujetti classique pour les mêmes achats.
Quand le passage en société change la donne
Les logiciels self-service comme Dexxter et Accountable sont conçus pour les indépendants personnes physiques. Si votre activité grandit et que vous envisagez de créer une SRL, vous devrez obligatoirement passer à une comptabilité en partie double, tenue par un professionnel agréé.
Ce changement de statut est souvent le moment où l’indépendant abandonne le logiciel self-service au profit d’un cabinet comptable. Le passage en société implique un bilan d’ouverture, une valorisation des actifs transférés et un plan financier. C’est un bon moment pour confier l’ensemble à un expert-comptable qui connaît les deux régimes.
Par exemple
Nadia est consultante à Bruxelles. Elle utilise Accountable depuis trois ans et facture 75 000 EUR par an. Son activité a grandi, et le passage en SRL lui permet de réduire sa charge fiscale globale. Accountable ne gérant pas les sociétés, Nadia confie sa comptabilité à myfid. Son conseiller dédié gère l’ensemble de la transition : bilan d’ouverture, inscription à la BCE, passage en comptabilité double, premières déclarations ISOC et calcul des versements anticipés. Nadia se concentre sur ses clients pendant que myfid s’occupe du reste.
Logiciel ou comptable : comment choisir ?
Un logiciel self-service peut suffire dans un cas précis : vous êtes indépendant personne physique, votre activité est simple (peu de transactions, pas d’opérations internationales), vous êtes à l’aise avec la fiscalité belge et vous avez le temps de vous occuper vous-même de vos obligations comptables des indépendants belges. Dans la pratique, cette situation reste minoritaire.
Dès que votre activité évolue — passage en société, croissance du chiffre d’affaires, opérations intracommunautaires, engagement de personnel — le logiciel atteint ses limites. Et les conséquences d’une erreur comptable ou fiscale dépassent largement le coût d’un accompagnement professionnel. L’erreur classique est d’attendre le contrôle TVA ou l’avis de rectification pour s’en rendre compte.
L’accompagnement par un expert-comptable ne se limite pas à encoder des factures. Votre comptable anticipe vos versements anticipés, structure vos frais professionnels, vous alerte sur les échéances et vous conseille sur les choix structurants (régime TVA, forme juridique, rémunération). C’est un investissement qui se rentabilise dès la première année pour la majorité des indépendants.
Chez myfid, chaque client bénéficie d’un conseiller dédié, spécialisé dans son secteur d’activité, qui répond sous 24 heures (jours ouvrés). Découvrez nos forfaits de comptabilité pour indépendants.
Questions fréquentes
Un indépendant est-il obligé d’utiliser un logiciel comptable ?
Non. Aucune loi belge n’impose l’utilisation d’un logiciel pour tenir une comptabilité simplifiée. Votre seule obligation est de respecter les règles du modèle comptable que vous avez adopté (comptabilité simplifiée ou en partie double) et les délais de déclaration.
En revanche, depuis janvier 2026, vous devez pouvoir émettre et recevoir des factures électroniques via Peppol pour vos transactions B2B. Un logiciel compatible ou un comptable équipé devient donc incontournable dans la pratique.
La facturation électronique Peppol est-elle obligatoire pour tous les indépendants ?
Oui, pour toutes les transactions B2B entre assujettis TVA belges. Si vous facturez exclusivement des particuliers (B2C), l’obligation ne s’applique pas encore. Les indépendants sous franchise TVA qui ne facturent qu’à des particuliers ne sont donc pas concernés pour l’instant.
L’e-reporting (transmission automatique des données de facturation au SPF Finances) est prévu pour 2028 et pourrait élargir ces obligations.
Quels sont les deux types de logiciels comptables ?
Il existe deux grandes catégories. Les logiciels téléchargeables (licence achetée, installation sur votre ordinateur) et les logiciels en ligne, dits SaaS (Software as a Service). Les solutions SaaS dominent le marché : elles sont accessibles depuis n’importe quel appareil, mises à jour automatiquement et sécurisées par le fournisseur. Dexxter, Accountable et Sayli sont tous des logiciels SaaS.
Un indépendant sous franchise TVA peut-il quand même déduire la TVA sur son logiciel comptable ?
Non. Le régime de franchise TVA (chiffre d’affaires inférieur à 25 000 EUR) dispense de facturer la TVA, mais interdit aussi la déduction de la TVA en amont. Votre abonnement logiciel, comme tous vos achats professionnels, vous coûte le prix TTC. C’est un élément à prendre en compte quand vous comparez les tarifs affichés « HTVA » des différents logiciels.
Existe-t-il des logiciels comptables gratuits fiables ?
Certains logiciels proposent une version gratuite, comme Accountable (calcul des impôts uniquement). Soyez attentif : les versions gratuites offrent souvent le strict minimum. La facturation, les déclarations TVA et le listing clients sont généralement réservés aux formules payantes. Avant de choisir un outil gratuit, vérifiez qu’il couvre vos obligations réelles, y compris la facturation Peppol.
Comment mon logiciel comptable évolue-t-il si je passe en société ?
Dexxter et Accountable ne gèrent que les personnes physiques. Si vous créez une SRL, vous devez passer à une comptabilité en partie double, ce qui exclut ces logiciels. Le passage en société est souvent le moment idéal pour confier votre comptabilité à un expert-comptable qui assurera la transition : bilan d’ouverture, choix du logiciel professionnel (WinBooks, Sage BOB), premières déclarations ISOC.
La déduction majorée de 120 % s’applique-t-elle aussi aux logiciels comptables (pas seulement de facturation) ?
La déduction majorée de 120 % vise les investissements dans la facturation électronique pour les exercices 2024 à 2027. Un logiciel qui combine comptabilité et facturation (comme Dexxter ou Accountable) entre dans le champ de cette mesure pour la partie facturation. Si vous utilisez un logiciel purement comptable sans module de facturation, la déduction majorée ne s’applique pas. Votre comptable peut vérifier quels abonnements sont éligibles dans votre cas.
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